Một vài tuyến đường sắt và đường bộ liên bang (Autobahnen và Bundesstraßen) đi qua kênh đào bằng 11 cầu lớn. Các cầu này có khoang trống cao 42 mét (138 ft) và cho phép các tàu cao đến 40 mét (130 ft) đi qua. Cầu cổ nhất vẫn được sử dụng là Cầu cao Levensau từ năm 1893; tuy nhiên, cây cầu sẽ phái được thay thế khi mở rộng kênh. Từ phía tây (Brunsbüttel) đến phía đông (Holtenau), có các cầu là:

• Cầu cao Brunsbüttel, với bốn làn xe của Bundesstraße 5
• Cầu cao Hochdonn của đường sắt Marsh
• Cầu cao Hohenhörn của Autobahn 23
• Cầu cao Grünental của tuyến đường sắt Neumünster-Heide và Bundesstraße 204
• Cầu cao Rendsburg của đường sắt Neumünster–Flensburg, cũng có một cầu băng tải phục vụ các phương tiện địa phương
• Kanaltunnel Rendsburg, hầm đường bộ của Bundesstraße 77 (bốn làn)
• Cầu cao Rade của Autobahn A7
• Levensau từ năm 1893 của đường sắt Kiel–Flensburg và cho một đường bộ địa phương
• Cầu cao Tân Levensau của Bundesstraße 76 (bốn làn)
• Cầu cao Holtenau, hai cầu song song với ba làn xe mỗi cầu, có hè cho người đi bộ và đi xe đạp

Các phương tiện địa phương có thể sử dụng 14 tuyến phà và một hầm đi bộ. Đáng chú ý nhất là cầu băng tải (tiếng Đức: Schwebefähre) bên dưới cầu cao Rendsburg. Tất cả các tuyến phà do Cơ quan Kênh đào phụ trách và phục vụ miễn phí.